科研经费使用效率低,存在公钱私用问题.在科研经费预算获得通过之后,由于缺乏严格的监管机制和科学的评估机制,很难保障科研经费的产出效率,投入多收益少.在一个科研项目中,有很大一部分科研经费变成了名目繁多的个人提成奖励,有的转化为科研单位沉淀资金,有的挪作他用或用于养人养机构,真正用于更新设研究备、购买研究资料、从事研究实验的的并不多.根据世界经济合作与发展组织(OECD)统计的数据显示,目前我国科研经费的投入占到世界的4.8%,而科研产出却占到世界的3.1%,我国科研投入产出的效率仍低于世界平均水平.我国的科研事业本来就是“僧多粥少”,加上科研经费的利用效率低下,科研产出与投入的比率较低,这都限制着我国科研事业的进一步发展.对课题经费监管缺乏动力,大多流于形式,内部监管制度形同虚设