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动物转录组测序数据中,singleton可以说是不能组装的单一read吗?contig是由reads组装而成,那么不能组装的reads是不是就是singletons?即contig和singleton都是uniquesequence?还有一种说法:singleton是指无法
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问题描述:

动物转录组测序数据中,singleton可以说是不能组装的单一read吗?

contig是由reads组装而成,那么不能组装的reads是不是就是singletons?即contig和singleton都是uniquesequence?

还有一种说法:singleton是指无法和其他片段匹配的单一的reads,或者contigs,或者scaffold.上述两种有关singleton的说法哪个对?

林沂蒙回答:
  singleton可以说是不能组装的单一read.这个名词是对于454来说的,第一种说法比较正确,因为454的读长较长,拼接不上的单一reads也是有分析价值的.
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