A.3-甲基-2-戊烯,主链为戊烯,碳碳双键在2号C,甲基在3号C,该命名符合烯烃的命名原则,故A正确;
B.2-甲基-2-丁烯,主链为丁烯,碳碳双键在2号C,甲基在2号C,该命名满足烯烃的命名要求,故B正确;
C.2,2-二甲基丙烷,又名异戊烷,主链为丙烷,在2号C含有2个甲基,该命名满足烷烃的命名原则,故C正确;
D.2-甲基-3-丁炔,该命名的编号方向错误,编号应该从距离碳碳三键最近的一端开始,碳碳三键在1号C,甲基在3号C,该有机物正确命名应该为:3-甲基-1-丁炔,故D错误;
故选D.