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您好!1.我也要做差异基因表达这方面的实验,但是我们不是看某个已知基因的表达差异,而是想看看有哪些基因有差异,所以用荧光定量不行吧?2.由于此种实验材料测序未成功,所以用芯片也不行
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问题描述:

您好!1.我也要做差异基因表达这方面的实验,但是我们不是看某个已知基

因的表达差异,而是想看看有哪些基因有差异,所以用荧光定量不行吧?2.由于此种实验材料测序未成功,所以用芯片也不行.荧光差异显示也过时了,那怎么办?3.请问现在还有什么比较先进的方法做mRNA水平上的基因差异(除了高通量测转录本之外)?

寇云起回答:
  若研究基因组中所有基因的表达差异,肯定要用芯片,不过前提如你所说需要全局测序.荧光差异显示就是荧光定量的前身而已,没有必要讨论.如果你要做未全局测序的一种植物,我猜想已知的基因大约也就几千个,你一一做qPCR也并非不可行.而且,如果你只是做对于一种外界环境反应的基因调控变化,相关的基因也就不超过10个,好好去读文献找到所有相关基因做semi-qPCR就可以看到mRNA水平上的基因差异了,根本不需要做全局的基因差异表达.
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