毫无疑问,近代自然哲学以近代自然科学为基础.其实,自从严格意义上的自然科学出现之后,自然哲学便以自然科学为先驱和基础了.在那之前,自然哲学并不严谨,有些观点在现在还显得十分可笑.随着自然科学的发展,自然哲学逐渐改进,每个时代,由于其主要发现不同,自然哲学的主要观点也有很大不同.总体上,哲学上最重要的思维方式却不见多大改进,改进的只有对自然的认识,而非认识方式和反思方法.但即便如此,自然哲学随着自然科学的发展,其观点的“可靠程度”也逐渐提高.所以,近代自然科学给近代自然哲学带来了更为准确的原材料,自然科学的某些探索方法也给自然哲学的思维方式提供了新的方向.另一方面,自然哲学也为自然科学提供大方向,提供了全新的假设和目标.