废水生物除磷工艺中,厌氧段有机基质的种类、含量及其与微生物营养物质的比值是影响除磷效果的重要因素.不同的有机物为基质时,磷的厌氧释放和好氧摄取是不同的.根据生物除磷原理,分子量较小的易降解的有机物易于被聚磷菌利用,将其体内储存的多聚磷酸盐分解释放出磷,诱导磷释放的能力较强;而高分子难降解的有机物诱导磷释放的能力较弱.厌氧阶段磷的释放越充分,好氧阶段磷的摄取量就越大.
另一方面,聚磷菌在厌氧段释放磷所产生的能量,主要用于其吸收进水中的低分子有机基质,合成PHB储存在体内,以作为其在厌氧条件压抑环境下生存的基础.因此,进水中是否含有足量的有机基质提供聚磷菌合成PHB,是关系到聚磷菌在厌氧调价下能否顺利生存的重要因素.一般认为,进水中BOD/TP﹥15才能保证聚磷菌有着足够的基质需求而获得良好的除磷效果.为此,有时可以采用部分进水和省去初沉池的方法来获得除磷所需要的BOD负荷.