眼虫既不属于动物类,也不属于植物类.它属于原生门生物,虽然能像普通植物一样进行光合作用来制造养分,但是它没有细胞壁. 　　眼虫的植物体为单细胞,外有坚固的周皮(periplast),顶端凹处有一胞口(cytostoma),口下有管状的胞咽(cytopharynx),基底则为一呈小胞状的贮存泡(reservoir),自细胞口至贮存泡为止的管道,就是食管(gullet). 　　从贮蓄泡之基底长出1-2条鞭毛,其基部具有小颗粒之毛基体(blepharoplast).鞭毛是由一或二条中纤维轴(axoneme),外包于一鞘层之内而构成,其长鞭毛属于栉(梳)型. 　　细胞口至贮蓄泡之间,在一侧面有眼点(stigma)和伸缩泡(contractilevacuole).眼点有感光的功用,由许多颗粒聚集在一个无色的凸凹模型内.靠近眼点的鞭毛上,有一膨胀部分,即鞭毛瘤(flagellarswelling),对光非常敏感,而眼点则对其有感光保护作用,以避免光线射到鞭毛之膨胀部分.眼点在细胞分裂时,亦是一分为二,由此可知其为已存在而非新生. 　　伸缩泡接近贮蓄泡,且与之相连.伸缩泡因废物之排出而常见消失,代之而来的则是液泡(vacuole),由此知伸缩泡是来自液泡.眼虫的体内有圆板形、薄板形或星形的色素体,所含的色素有叶绿素a和b,类胡萝卜素及叶黄素等,每色素体中藏有一淀粉核(pyrenoid). 　　眼虫的叶绿体为叶绿体内质网所围绕,其中的叶绿饼(grana)由3层的叶绿层(thylakoid)所迭成. 　　眼虫体内有明显的核,核的中心有明显的内体(endosome),在核的附近有连接核与毛基体的纤维状构造,称为根索(rhizoplast),其靠近核的一端有一小颗粒,称为根索粒(rhizoplasticgranule).除此之外,眼虫细胞内尚有粒腺体、液泡、高尔基质和黏液体等. 　　眼虫的生殖 　　眼虫的生活史可有三个时期,即鞭毛时期、胞囊时期及不定群体时期.不过不定群体时期并非所有眼虫类有之. 　　眼虫之生殖,以无性之二纵分裂为主,并发生于鞭毛时期.所谓二纵分裂,就是在体分裂之前,先由核及其中的内体,按照普通之核分裂方法,包括经过前期、中期、后期及末期等次序,最后体亦随之纵向分为两半而完成两个子个体. 　　除上述纵分生殖外,眼虫又能产生细胞壁薄之胞囊(cyst)来繁殖.胞囊之型式有分裂胞囊、休止胞囊及保护胞囊等.保护胞囊其内为单细胞,具有较厚壁,分裂胞囊内有多细胞或单细胞,囊壁颇薄,休止胞囊的壁颇厚,细胞尚具鞭毛且可在囊内活动. 　　眼虫的有性生殖,虽亦有事实的报导,但详细情形仍未完全明朗. 　　眼虫的生理生态 　　眼虫依栖息环境的不同,其生理大有差异.一般水里的眼虫都利用其叶绿素来营光合作用.眼虫所含胡萝卜素之主要者,则为β-胡萝卜素,其它尚有花黄素(antheraxanthin),青绿素(astaxanthin),新黄素(neoxanthin)及玉米黄素(zeaxanthin)等.和光合作用有关的色素,在眼虫类是以叶绿素b为主. 　　眼虫营光合作用,其同化产物为油脂与眼虫淀粉.后者在淀粉核之表面形成,然后自核面分离出来.所谓眼虫淀粉是一种高分子的醣类,不为碘液或氧化锌染色,可溶于浓硫酸和氢氧化钾,可水解为葡萄糖.主要的油脂为麦角醇(ergosterol). 　　眼虫种类中当然也有不具光合成色素而完全要靠有机营养而生存者.在不含叶绿素而专营有机营养而生活者,则全赖有机化合物为碳素的来源. 　　眼虫高速度的鞭毛运动,即鞭毛自基部开始渐次旋动,使水成波而向顶端推进.除泳动之外,尚有作滑行或匍匐运动者. 　　眼虫的分布 　　眼虫每多量存在于富含有机物质的淡水,例如湖沼和池塘内,因为其含量特多,每使淡水变色,例如扁眼虫使水变绿以及糙皮藻使水变成黄褐色等,特别是在水温较高时更是如此. 　　眼虫的分布以淡水为主,但在河堤、海湾湿土或含盐沼泽中亦有之,此外在其它藻类体上、植物碎片、及小甲壳类的体上亦能见到.至于营有机性的种类则多见之于下水道的水内.