土壤中有机质的来源十分广泛.
(1)植物残体:包括各类植物的凋落物、死亡的植物体及根系.这是自然状态下土壤有机质的主要来源.对森林土壤尤为重要.森林土壤相对农业土壤而言具有大量的凋落物和庞大的树木根系等特点.中国林业土壤每年归还土壤的凋落物干物质量按气候植被带划分,依次为:热带雨林,亚热带常绿阔叶林和落叶阔叶林,暧温带落时阔时林,温带针阔混交林,寒温带针叶林.热带雨林凋落物干物质量可达16700Kg/(km2·a),而荒漠植物群落凋落物干物质量仅为530kg/(nm2·a).
(2)动物、微生物残体:包括土壤动物和非土壤动物的残体,及各种微生物的残体..这部分来源相对较少.但对原始土壤来说,微生物是土壤有机质的最早来源.
(3)动物、植物、微生物的排泄物和分泌物:土壤有机质的这部分来源虽然量很少,但对土壤有机质的转化起着非常重要的作用.
(4)人为施入土壤中的各种有机肥料(绿肥、堆肥、沤肥等),工农业和生活废水,废渣等,还有各种微生物制品,有机农药等.
土壤有机质的矿质化过程分为化学的转化过程、活动物的转化过程和微生物的转化过程.这一过程使土壤有机质转化为二氧化碳、水、氨和矿质养分(磷、硫、钾、钙、镁等简单化合物或离子),同时释放出能量.这一过程为植物和土壤微生物提供了养分和活动能量,并直接或间接地影响着土壤性质,同时也为合成腐殖质提供了物质基础.