A、根据化学元素汉字名称的偏旁可辨别元素的种类,金属元素名称一般有“金”字旁,钇元素属于金属元素,故说法错误;
B、稀土元素钇在元素周期表中原子序数为39,根据核电荷数=原子序数可知,钇元素的核电荷数为39,故说法错误;
C、钇在元素周期表中原子序数为39,相对原子质量为89,根据质子数=原子序数可知,钇元素的质子数是39,根据相对原子质量=质子数+中子数可知,钇元素原子核内的中子数为89-39=50,故说法正确;
D、钇在元素周期表中原子序数为39,根据核外电子数=原子序数可知,钇元素原子的核外电子数是39,原子失去电子得到离子,因此钇离子的核外电子总数不是39,故说法错误.
故选:C.