A、基因工程是指按照人们的意愿,进行严格的设计,并通过体外DNA重组和转基因等技术,赋予生物以新的遗传特性,从而创造出更符合人们需要的新的生物类型和生物产品.可见,基因工程能打破物种界限,定向地改造生物性状,故A正确;
B、蛋白质工程指以蛋白质的结构规律及其与生物功能的关系作为基础,通过基因修饰或基因合成,对现有蛋白质进行基因改造,或制造一种新的蛋白质,以满足人类的生产和生活的需要,故B错误;
C、利用植物组织培养技术能打破物种之间的界限,培育出“番茄一马铃薯”植株,故C正确;
D、单克隆抗体制备过程中采用了细胞融合和动物细胞培养技术,故D正确.
故选:B.