A、西气东输工程起点是在塔里木盆地,沿途经过的地形区有塔里木盆地,河西走廊,黄土高原,华北平原,长江中下游平原.跨越了我国二、三阶梯,故错误;
B、西气东输工程起点是在塔里木盆地,途径地形区:塔里木盆地-吐鲁番盆地-河西走廊-宁夏平原-黄土高原-华北平原-长江中下游平原.故正确;
C、两条线都到长三角,到珠三角只有二线工程,故正确;
D、西一线:起于新疆轮南,途经新疆、甘肃、宁夏、陕西、山西、河南、安徽、江苏,东抵上海,全长4000公里.西气东输二线工程西起新疆霍尔果斯口岸,南至广州,途经新疆、甘肃、宁夏、陕西、河南、湖北、江西、湖南、广东、广西等10个省区市.故正确;
故选:A.