【请仔细阅读详细提问后回答：RNA转录的DNA模板是3‘-->5‘,那所谓模板5’上游的TATA盒其实应该是3‘下游吗根据搜寻的资料,已知---DNA之所以能转录取决于：①特异的转录起点；②转录的方向；】
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问题描述：
请仔细阅读详细提问后回答：RNA转录的DNA模板是3‘-->5‘,那所谓模板5’上游的TATA盒其实应该是3‘下游吗
根据搜寻的资料,已知---DNA之所以能转录取决于：①特异的转录起点；②转录的方向；③转录开始后按碱基互补配对原则准确地转录；④特异终止部位等几个方面.转录起始的关键是RNA聚合酶与启动子的相互作用.
位于上游的TATA被RNA聚合酶识别结合后开始转录,因为RNA聚合酶同DNA聚合酶一样,只能催化单核苷酸加接到带游离3’-OH的多核苷酸链上,就是说RNA合成时只能以5‘→3’的方向合成互补于DNA模板链的RNA链.这就决定了转录的方向.因为mRNA的5‘端编码着起始密码子5’-AUG-3‘,那么其模板DNA的序列是5’-CAT-3‘.而位于编码链ATG上游的TATA盒对应的位于模板链CAT的3’下游.
我的问题是,如果根据大众的说法,“RNA聚合酶及转录复合体是特异识别结合启动子上游的TATA”,（请注意“上游”这两个字,也就意味着TATA在启动子的5‘端,从TATA到启动子的方向就是5’->3‘）,那么这个结合是在编码链上的,因此也无法进行5’->3‘的RNA合成延伸.是否这个说法其实是错误的.应该是特异识别结合启动子上游TATA在互补链上对应的位置而启动转录的呢?
孙振刚回答：
1）“RNA聚合酶及转录复合体是特异识别结合启动子上游的TATA”不知道是出自哪儿?
2）启动子可以简单的理解为起始合成RNA的DNA序列,这样话,TATAbox实际上可以算是一个基本的启动子元件,或者说是启动子包含了TATAbox,当然启动子中还含有很多其他的元件,可以与转录因子结合,调节基因的转录.
3）我们一般所讲的基因的上游和下游是对照mRNA的5-3的顺序将的来讲的,而不是DNA.
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