A、①在太空飞行期间的“神舟”七号飞船属于人造天体;②河外星系属于天体系统,不属于天体;③2009年2月15日,美俄卫星太空相撞产生的碎片,属于自然天体.②不正确,故不符合题意;
B、②河外星系属于天体系统,不属于天体;③2009年2月15日,美俄卫星太空相撞产生的碎片,属于自然天体;④飞行在太空中的“神舟”七号飞船的伴飞小卫星,属于人造天体.②不正确,故不符合题意;
C、①在太空飞行期间的“神舟”七号飞船属于人造天体;③2009年2月15日,美俄卫星太空相撞产生的碎片,属于自然天体;④飞行在太空中的“神舟”七号飞船的伴飞小卫星,属于人造天体.故正确;
D、②河外星系属于天体系统,不属于天体;④飞行在太空中的“神舟”七号飞船的伴飞小卫星,属于人造天体;⑤天空中飘动的云,不属于天体.②、⑤不正确,故不符合题意.
故选:C.